El eje transversal Género y Juventud tiene como objetivo contribuir a una mayor equidad e igualdad en el desarrollo agrícola y de los territorios rurales, a través de la transversalización de los enfoques de género y juventud en las diferentes acciones que el IICA promueve. Para lo anterior, apoya la visibilización de la situación e importancia de las mujeres y jóvenes rurales; el fortalecimiento de capacidades en temas relativos a género y juventud; el desarrollo de políticas, programas y propuestas que mejoren la autonomía económica de jóvenes y mujeres; y la mejora de la capacidad de incidencia de éstos.
El eje operativiza su trabajo de tres formas diferentes: i) a partir de las acciones concretas desarrolladas por los Programas a nivel hemisférico y país; ii) en respuesta a demandas específicas de Oficinas del IICA en los países, así como de otras diferentes intancias institucionales; y, iii) mediante el desarrollo de acciones hemisféricas propias del eje.